21 martie 2014
13 februarie 2014
Local alignment of sequence
Aceasta postare este o continuare la Global alignment of DNA sequence, cu diferenta ca matricea de valori este initializata toata cu 0 (inclusiv marginile), iar valorile negative din matricea de costuri sunt rotunjite la 0.
Am considerat costurile: match = 2, mismatch = -1, gap = -2
Am considerat costurile: match = 2, mismatch = -1, gap = -2
Prima matrice: costurile
A doua matrice: precedenta - 0 (diagonala), 1 (vine de sus), 2 (vine din stanga), -1 (neinitializat)
Sursa se afla aici.
A doua matrice: precedenta - 0 (diagonala), 1 (vine de sus), 2 (vine din stanga), -1 (neinitializat)
Sursa se afla aici.
12 februarie 2014
Global alignment of DNA sequence (Python)
Programul gaseste o aliniere intre doua secvente {acgt} astfel incat castigul sa fie maxim.
Costuri considerate: match = 1 ; mismatch = -1 ; gap = -2
Exemplu de rulare:
Sursa se afla aici.Costuri considerate: match = 1 ; mismatch = -1 ; gap = -2
Exemplu de rulare:
31 ianuarie 2014
Amintiri din Poli
Acel moment cand popcorn intarzie 55 min la examen, vine total nepregatit si incearca fara succes sa scoata niste subiecte din cap, dureaza 10 min sa dicteze o intrebare grila + 4 raspunsuri dintre care te prinzi care e ala corect pt ca il zice instant si la alea gresite se gandeste cate 1 min gen : "ĂĂĂĂĂ, MMMMM" -- via Facebook
Abonați-vă la:
Postări (Atom)